In den meisten Fällen ist die versteinernde Substanz Kieselsäure, die Chalcedon oder Opal bildet; es kann jedoch auch Pyrit, Galenit, Hämatit (mit Goethit), Bernstein, Baryt oder seltener Fluorit sein. Als Heilsteine werden jedoch fast ausschließlich Kieselhölzer verwendet, die der Quarzgruppe oder den Opalen und damit der MIneralklasse der Oxide angehören.